重庆西科水运工程咨询有限公司前身为水利电力部、交通运输部西南水利水运工程科学研究所，始建于1965年，于1986年6月并入重庆交通大学。2022年3月，公司整体划转至重庆交大国科航科技有限公司。2024年9月，根据重庆市委、市政府“三攻坚一盘活”的改革部署，划转至重庆设计集团有限公司。

公司是西南地区目前规模最大的从事水利水电工程、港口与航道工程、河流泥沙和通航建筑工程的专业科研机构，是市政府授予的专精特新企业、知识产权优势企业、高新技术企业及创新型中小企业。公司拥有院士专家工作站、中小企业技术研究中心等高端科研平台，下辖广东、成都、浙江、云南、武汉、广西6家分公司；内设河流保护与治理技术研究中心、港口与航道技术研究中心、水工及河流泥沙技术研究中心、智慧水运规划设计研究中心、信息化与健康监测技术研究中心等5个专业研究中心，以及综合办公室、财务部、经营部等3个职能部门。共有从业人员100余人，其中硕博士研究生学历占比近80%，高级职称占比近50%；公司院士工作站聘院士1人、全国勘察设计大师1人、国内知名专家若干；公司特聘首席科学家1人，享受国务院特殊津贴。

公司拥有水运（港口河海工程）甲级咨询资质、水利水电甲级咨询资质，水运行业（港口工程甲级，航道工程甲级）设计资质，水文水资源调查评价乙级资质，水资源论证乙级资质，建有三峡、港航、水工、船模、基础水力学等多座试验大厅，试验厅总面积近1.8万m²，拥有占地面积约4万m²的大型露天试验场，新扩展有400余亩的试验基地，配备了较完善和大型的清浑水试验系统(供水能力达3m³/s)，研制和开发了小比尺自航船模及水位、流速、流量控制、泥沙分析测试等先进设备，具有雄厚的技术实力和软硬件条件。公司业务类型主要包括大型枢纽水力学与通航关键技术、内河航道整治关键技术、内河港口设计建设与智能化管养技术、暴雨洪水与城市内涝防灾减灾技术、跨拦临建筑物涉水安全与评估技术、水工建筑物原型模型量测技术与设备研发、桥梁防撞新技术新结构研发等，研究成果广泛应用于各大型工程，为国家经济建设做出重大贡献，多次荣获省部级、市级各类科技奖励。

公司秉持“善利百川，创新报国”的价值观，坚持“诚信服务，合作共赢，科创图强”的经营理念，做精做专涉水工程咨询、科研、设计技术服务，立足西南华南水运大通道，深耕华中华东水网，面向全国大江大河，走向世界江河湖海，打造成为西部第一、国内一流、特色鲜明的科研、咨询、设计一体化水利水运综合科研服务企业，为砥砺建设交通强国、实现中国式现代化而奔流不息。